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【单细胞转录组测序】VS【单细胞核转录组测序】结果对比

阅读次数:872   发布时间:2021/4/12 15:30:10

【单细胞转录组测序】VS【单细胞核转录组测序】结果对比:
 
1、随着测序深度的不断增加,单细胞核转录组测序(snRNA-seq)和单细胞转录组测序(scRNA-seq)得到的基因数相近。

2、单细胞核转录组测序在细胞分群上与单细胞转录组测序没有区别。

3、单细胞核转录组测序可有效挖掘稀有细胞类型。

4、单细胞核转录组测序结果中发现较少压力相关基因的表达。

结论: 小鼠大脑皮层,相比于消化细胞,细胞核的表达情况更接近于原始组织样本。
冷冻样本和难消化样本的完美解决方案
 
1、适用于冻存组织样品;克服新鲜样品时效性限制;
 
2、适用于难以制备单细胞悬液的组织样品;
 
3、减少解离偏差,能更好地保留细胞类型多样性;
 
4、不需要酶促消化,真实反映细胞的组分。
MN-c, 小鼠皮质神经元MN-c, mouse cortical neurons
MN-h, 小鼠海马神经元MN-h, in hippocampal neurons of mice
MSC, 小鼠雪旺细胞MSC, mouse Schwann cells
MA, 小鼠星形胶质细胞MA, mouse astrocytes
MLF, 小鼠淋巴成纤维细胞MLF, mouse Lymphatic Fibroblasts
mRTEC, 小鼠肾小管上皮细胞MRTEC, mouse renal tubular epithelial cells
CSC, 小鼠心肌细胞CSC, mouse myocardial cells
mEPC, 小鼠内皮祖细胞-骨髓MEPC, murine bone marrow endothelial progenitor cells
MEF, 小鼠胚胎成纤维细胞MEF, mouse embryonic fibroblast cells
NSC,大鼠神经干细胞NSC, rat neural stem cells
RN-h, 大鼠海马趾神经元RN-h, rat hippocampal neurons
rEPC,大鼠内皮祖细胞-骨髓REPC, rat endothelial progenitor cells of bone marrow
RN-c, 大鼠皮质神经元RN-c, in rat cortical neurons
RN-s, 大鼠纹状体神经元RN-s neurons of rat striatum
RSC, 大鼠雪旺细胞RSC, rat Schwann cells
RA, 大鼠星形胶质细胞RA, rat astrocytes
RLF, 大鼠淋巴成纤维细胞RLF, rat Lymphatic Fibroblasts
rRTEC, 大鼠肾小管上皮细胞RRTEC, rat renal tubular epithelial cells
 

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